Évtizednyi stagnálás után, az újabb generáció színre lépésével lassan ismét beindult a szakmai munka is: 1996-ban készült az első műfészek, az óta összesen 27 műfészek került ki parlagi sas, kerecsen és vándorsólyom, valamint fekete és fehérgólya részére. Beindult a fokozottan védett ragadozó madarakra és a feketególyára a rendszeres monitoring, évente jelentésben összegezzük az elért eredményeket, amit 2001. óta minden tag megkap. A feketególyák színes gyűrűzési programjában 2003. óta veszünk részt, eddig 79 madarat gyűrűztünk, és 24 visszajelzés érkezett, köztük olyan érdekességek, mint a gibraltári, vagy az angliai leolvasás.
Újra indult a fehér gólya monitoring, immár a monitoring központ adatbázisába való feltöltéssel. 2000. évben új programot indítottunk kb. 5000 ha-os mintaterületen a gyakori ragadozó madarak felmérésére, amely 3 évig tartott, majd hasonló programot végeztünk Cserhátalján a szóri erdőben. Ezt a programot tíz év után most megismételjük. 2007-2009. években különböző programokhoz kapcsolódva a harkályfélék, különösen a fehérhátú fakopáncs felmérését végeztük önkénteseinkkel kb. 10 km2 területen, kutatásunkkal egyetemi szakdolgozat készült, és hiánypótló adatokkal szolgáltunk a faj védelméhez.

2002. évtől az odútelep program, Nagy Csaba vezetésével, mindmáig egyik legsikeresebb programunk. Az elmúlt években 47 telepet hoztunk létre, a cseréket és karbantartást is figyelembe véve 1150 odút helyeztünk ki, melyet tagjaink készítettek. A telepek kb. 90% át ellenőrizzük rendszeresen, idényenként többször, így mintegy 11 ezer ellenőrzést tudhatunk magunk mögött. Egy-egy odúkihelyező túra egyben közösségi esemény is.
2000. évtől már a ragadozó szakosztállyal közösen szerveztük a kerecsen sólyomfészek őrzést, amire pályázati forrásokat szereztünk, azonban néhány évvel később a kerecsen elhagyta a Börzsönyt. A vándorsólyom fészeknél a 1998-as megtelepedése óta hétvégi napokon őrzést biztosítunk szinte minden évben.
A ragadozóvédelmi szakosztállyal együttműködve, a 80-as évektől tartottunk sérült madarakat, de 2002-től kiteljesedett a madármentés, miután Kertész doktor tanyáján is létesítettünk kezelő voliereket. Azóta - pályázatok segítségével - többször átépített madártartó helyeken folyamatosan fogadunk és gyógyítunk madarakat. Évente kb. 20-30 példányt látunk el.
2003. évben helyi csoportunk háttérintézményeként megalapítottuk a Börzsöny Alapítványt. Az alapítvány fő célja a tábor és a természetvédelmi munkánk segítése, de ezzel már kiléptünk a madárvédelemből, a tágabb természet, és környezetvédelembe. Pályáztunk, és programot indítottunk a magyarföldi husáng bekerítésére, a kétéltűek felmérésére, a hiúz foto csapdás monitorozására, denevér lakta bányajárat lezárására és a tábor eszközeinek fejlesztésére. Az Alapítvány pályázati programjait a helyi csoport tagságának önkénteseivel valósítjuk meg. Végeztünk forráskutatást, gyepkezelést, és cserjeirtást, ismeretterjesztő táblát állítottunk, és szemétszedő akciókat tartottunk.